e-Science 2012 Agenda (16th July, 2012, 09:00h-18:30h in the Simepar Room)
9:00-10:00, session 1: Bioinformatics - part 1
| SNPs detection in Klebsiella pneumoniae Nicholas Lima (Laboratório Nacional de Computação Científica), Maurício Egídeo Cantão (EMBRAPA Suínos e Aves), Marisa Nicolás (LNCC) |
| Algoritmo na linguagem PERL para busca de erros e não conformidades em um banco de dados biológico público Katia Lopes (Universidade Federal do Paraná), Flávia Gomes da Silva (Faculdade Anhanguera de Belo Horizonte), Sandro Renato Dias (Universidade Federal de Minas Gerais) |
| Estudo e aplicação de medidas de similaridade semântica na visualização das interações gênicas em Esquizofrenia Lulu Wu (University of São Paulo), Roberto Costa Filho (Universidade de São Paulo), Evandro Ruiz (Universidade de São Paulo) |
| Avaliação topológica de redes gênicas de esquizofrenia usando abordagens de redes complexas Amanda Sayuri Guimarães (University of São Paulo), Evandro Ruiz (Universidade de São Paulo) |
10:00-10:30, session 2: Bioinformatics - posters
| Modelagem de um banco de dados relacional para um sistema Web de Cianobactérias sincronizado com o NCBI Vitor Santos (Universidade Federal do Pará), Walbert Nascimento (Universidade Federal do Pará - UFPA), Regiane Kawasaki (Universidade Federal do Pará), Maria Paula Schneider (Universidade Federal do Pará), Danielle Couto (Universidade Federal do Pará) |
| Autoassembly: Uma ferramenta para automação do processo de montagem de genomas procariotos Nilson Coimbra (Universidade Federal do Pará), Alex Lima (Universidade Federal do Pará), Pablo Sá (Universidade Federal do Pará), Rommel Thiago Ramos (IESAM), Artur Silva (Universidade Federal do Pará) |
| Identificação de tandem repeats no dermatófito Trichophyton Rubrum Matheus Franco (IFSULDEMINAS) |
| Ambiente Computacional para Modelagem de Redes de Regulação Gênica Raquel Costa (LNCC), Marcelo Alves (Fiocruz), Fabio Andre Porto (LNCC) |
| Identification of coding sequences with conflicting attributes in the complete genome of Klebsiella pneumoniae Kp13 using ProkSCAs Tool Guadalupe Quispe Saji (LNCC), Mauricio Cantão (University of São Paulo), Marisa Nicolás (LNCC) |
| Adaptive Evolution of Falcipain-Homologues in Plasmodium Kary Ocaña (COPPE/UFRJ), Daniel de Oliveira (COPPE/UFRJ), Marta Mattoso (COPPE/UFRJ) |
| Análise comparativa de isolados de Staphylococcus aureus resistentes à meticilina com diferentes padrões de expressão de biofilme Maiana Costa (Laboratório Nacional de Computação Científica), Luiz Gonzaga P. Almeida (Laboratório Nacional de Computação Científica), Ana Tereza Vasconcelos (Laboratório Nacional de Computação Científica), Nicholas C. B. Lima (Laboratório Nacional de Computação Científica), Fabienne A. Ferreira (Universidade Federal do Rio de Janeiro), Cristiana O. Beltrame (Universidade Federal do Rio de Janeiro) |
| BioSom: Metodologia para identificação de sinônimos de genes utilizando Self Organizing Maps. K. R. Otemaier (UFPR), Berenice Steffens (UFPR), Roberto Tadeu Raittz (Federal University of Parana), Jeroniza Marchaukoski (UFPR) |
10:30-11:00, Interval
11:00-12:00, session 3: Bioinformatics - part 2
| Curvature, bendability, stability and nucleotide composition applied to E. coli s28 promoter prediction and recognition Tahila Andrighetti (Universidade de Caxias do Sul), Priscila Portela (Universidade de Caxias do Sul), Ivaine Taís Sauthier Sartor (Universidade Federal do Rio Grande do Sul), Günther Gerhardt (Universidade de Caxias do Sul), Sério Echeverrigaray (Universidade de Caxias do Sul), Scheila de Avila e Silva (Universidade de Caxias do Sul) |
| Ferramenta Computacional para Coleta e Análise de dados Laboratoriais de Enteropatógenos Luiz Neves (Federal University of Parana - UFPR), Terumi Kamada (Federal University of Parana), Alan C. Ignacio (UFPR), Rodrigo Resende (UFPR), Vinicius F. Correa (UFPR), Rodrigo A. da Rocha (UFPR) |
| Framework para Integração de Web Services em um Pipeline de Anotação de Sequências de Nova Geração Milene Ferro (Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho"), Wélliton Souza (Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho"), Erik Aceiro Antonio (Universidade Federal de São Carlos (UFSCar)), Maurício Bacci Júnior (Unesp) |
| Regiões de plasticidade genômica e reconstrução metabólica in silico de um isolado clínico de Klebsiella pneumoniae causador de surto hospitalar Pablo Ramos (Laboratório Nacional de Computação Científica), Cecília Klein (INRIA Rhône‐Alpes, UMR 5558 Biométrie et Biologie Évolutive, Université Claude Bernard, Ly), Ana Gales (Laboratório Especial de Microbiologia Clínica, Disciplina de Doenças Infecciosas e Parasitárias,), Ana Tereza Vasconcelos (Laboratório Nacional de Computação Científica), Marie-France Sagot (INRIA & University Lyon 1), Marisa Nicolás (LNCC) |
12:00-12:30, session 4: Bioinformatics Keynote
16:00-16:30, lunch break
16:30-16:45, session 5: Astronomy - posters
| CRAAM-SVO: Observatório Virtual Solar do Centro de Rádio Astronomia e Astrofísica Mackenzie Israel dos Santos (Universidade Presbiteriana Mackenzie), Omar Nizan (Universidade Mackenzie), Adriana Valio (Universidade Presbiteriana Mackenzie) |
| Cosmobook - An Environment for Panoramic Photometry Reinaldo de Carvalho (INPE), Joao Luiz Kohl-Moreira (Observatório Nacional - MCT), Claudinei Walker Silva (National Institute for Space Research), Cesar Strauss (DAS/INPE MCT), Marina Trevisan (Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais), Francesco La Barbera (OAC/INAF) |
| Efficient databases for hyperspectral observations by array processing Paulo Penteado (Universidade de São Paulo) |
| Perceptually uniform colormaps for data visualization Paulo Penteado (Universidade de São Paulo) |
16:45-18:00, session 6: Astronomy
| Análise multi-espectral de galáxias: o banco de dados STARLIGHT/SDSS/GALEX/WISE André Amorim (Universidade Federal de Santa Catarina), Eduardo Lacerda (Universidade Federal de Santa Catarina), Abílio Mateus (Universidade Federal de Santa Catarina), William Schoenell (CSIC-IAA), Roberto Cid Fernandes (Universidade Federal de Santa Catarina), Fábio Herpich (Universidade Federal de Santa Catarina) |
| Unsupervised photometric membership assignment in stellar clusters Alberto Krone-Martins (Universidade de Lisboa), André Moitinho de Almeida (Universidade de Lisboa) |
| Pushing the limits of the Gaia space mission through the analysis of galaxy morphology Alberto Krone-Martins (Universidade de Lisboa), Christine Ducourant (LAB/Université de Bordeaux), Ramachrisna Teixeira (IAG/Universidade de São Paulo), Laurent Galluccio (Observatoire de la Côte d'Azur), Panagiotis Gavras (Observatoire de Paris), Sandra dos Anjos (IAG/Universidade de São Paulo) |
| A web-based e-Science Analysis Center for large-collaboration
astrophysics analysis. Application to the Dark Energy Survey Ricardo Ogando (ON-MCTI & LIneA), Luiz da Costa (LIneA & ON), Angelo Fausti Neto (Observatório Nacional), Christophe Benoist (OCA), Patricia Egeland (Observatório Nacional), Marcio Maia (Observatorio Nacional) |
| A New Web Service for STARLIGHT Marina Trevisan (Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais), Walter Abrahão Dos Santos (INPE The Brazilian Institute for Space Research), Reinaldo de Carvalho (INPE), Roberto Cid Fernandes (Universidade Federal de Santa Catarina), Francesco La Barbera (OAC/INAF), Ignacio Ferreras (MSSL/UCL) |
18:00-18:30, session 7: Astronomy - Keynote
Spearker: David Schadee-Science 2012 Agenda (17th July, 2012, 09:00h-18:30h in the Simepar Room)
9:00-10:30, session 8: Computer Science - part 1
| An Analytical Data Management as a Cloud Service for Numerical Simulations Ramon Costa (LNCC), Fabio Andre Porto (LNCC), Bruno Schulze (LNCC) |
| Integrating and processing events from Heterogeneous Data Sources Ivo Koga (University of Campinas), Claudia Bauzer Medeiros (IC-UNICAMP) |
| Desenvolvimento de um Modelo Conceitual de um banco de dados para o Projeto e-phenology Greice Mariano (Universidade Estadual de Campinas), Jurandy Almeida (Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)), Ricardo Torres (Unicamp), Bruna Alberton (Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquista Filho"), Leonor Morellato (Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquista Filho") |
| Impacto de Estratágias de Balanceamento no Problema de Classificação de Sítios de Splice Claudia Varassin (Universidade federal Espirito Santo (UFES)/ Universiadade Federal Fluminense), Alexandre Plastino (Universidade Federal Fluminense), Bianca Zadrozny (IBM Research Brazil), Helena Cristina Gama Leitão (Universidade Federal Fluminense) |
| Um Modelo de Estrutura Organizacional em Plataformas de E-Science Glauber Vaz (Embrapa Informática Agropecuária), Tercia Torres (Embrapa Informática Agropecuária), Poliana Giachetto (Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Embrapa), Silvia Massruhá (EMBRAPA) |
10:30-11:00, Interval
11:00-11:30, session 9: Computer Science - part 2
| Monitoramento em Tempo Real de Workflows Científicos Executados em Paralelo em Ambientes Distribuídos Julliano Pintas (COPPE/UFRJ), Daniel de Oliveira (COPPE/UFRJ), Kary Ocaña (COPPE/UFRJ), Jonas Dias (COPPE/UFRJ), Marta Mattoso (COPPE/UFRJ) |
| Extending scientific workflows for managing hypotheses and models Bernardo Gonçalves (LNCC), Fabio Andre Porto (LNCC), Ana Maria de Carvalho Moura (LNCC/RJ) |
11:30-12:30, session 10: Computer Science - Keynote
16:00-16:30, lunch break
16:30-17:30, session 11: Computer Science - posters
| CloudSatCD um Ambiente de e-Engineering em Nuvem para o Projeto Conceitual de Satélites Alex Barbosa Bastos (Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (INPE)), Walter Abrahão Dos Santos (INPE The Brazilian Institute for Space Research) |
| Um observatório solar virtual na era da e-Science Israel dos Santos (Universidade Presbiteriana Mackenzie), Omar Nizan (Universidade Mackenzie), Adriana Valio (Universidade Presbiteriana Mackenzie) |
| NanoTrack - Sistema Inteligente de Gerenciamento de Dados de Síntese de Nanoestruturas de Dados de Síntese de Nanoestruturas André Silva (Universidade Federal de Minas Gerais), Paulo Batista (Universidade Federal de Minas Gerais), Thamara Andrade (Universidade Federal de Minas Gerais), Omar Vilela Neto (Universidade Federal de Minas Gerais), Sergio Campos (Universidade Federal de Minas Gerais), Alessandra Faria-Campos (Universidade Federal de Minas Gerais) |
| Um Cluster Virtual Automatizado para Reuso de Recursos Ociosos em um Laboratório Universitário de Uso Geral David Willians Beserra (Universidade Federal Rural de Pernambuco), Alexandre Borba (UFRPE - Universidade Federal Rural de Pernambuco), Mariel Andrade (UFRPE), Alberto E. P. de Araujo (Universidade Federal Rural de Pernambuco) |
17:30-18:30, session 12: Retrospective analysis and Planning for 2013
| VI e-Science workshop (2012) Eduardo Bezerra (CEFET/RJ), Eduardo Ogasawara (CEFET/RJ), Fabio Andre Porto (LNCC), Marisa Nicolás (LNCC), Vanessa Braganholo (UFF), Maria Claudia Cavalcanti (Instituto Militar de Engenharia) |
